补脾益肠丸可以治肠炎，它主要针对脾胃虚弱、脾肾阳虚所导致的大便稀溏、腹部疼痛、腹部不适、便前腹痛便后缓解，大便中夹有不消化的食物还有五更泻，具有较好的疗效。因为它含有健脾益气类和四君子汤的组成成分，另外它与四神丸加减治疗，具有健脾补气和温补肾阳的作用，所以对脾气虚弱、脾肾阳虚的病人疗效较好。
部分病人是五更泻，即早上黎明出现腹痛、肠鸣、腹部不适、便急，上完厕所以后腹痛缓解，大便多且稀溏，而且大便次数增多。这些都属于脾肾阳虚，可以用补脾益肠丸来治疗。还有病人属于脾气虚弱、脾阳不振，会出现面色苍白、面色微黄、气短乏力，长期腹泻、腹部不适、舌淡、苔白、脉弱，也可以用补脾益肠丸进行健脾益气、制衡脾阳治疗。
