脚趾甲根部局部压痛，常见原因如下：

1、炎症：部分反复甲根炎症或甲沟炎症，会导致指甲根部按压疼痛；

2、关节病变：由于指甲根部临近关节，部分关节病变也会引起指甲疼痛。如关节退变后出现骨质增生，或局部关节液渗出形成关节囊肿时，挤压甲根可出现甲根疼痛；

3、占位性肿瘤：称为血管球瘤，属于局部按压疼痛难忍、不能触碰的疾病，多见于甲根、甲旁或甲床下方，存在局灶性病变，遇到冷水后受到刺激会出现剧烈疼痛。

对于长时间大脚趾甲根部疼痛患者，建议到医院咨询专科医生，进行体检以明确原因并及早治疗。