痣上长毛是因为局部皮肤色素痣和毛发毛囊结构位于同一个部位。色素痣本身由黑色素细胞在表皮真皮交界或者真皮内部聚集成团而形成，在痣团块局部本身就可能有毛发、毛囊结构。由于色素痣局部可能往往有血液供应相对丰富的现象，所以也可以导致局部毛囊、毛发供血充足，这样上面可能长出来毛发相对更加明显、更粗、更黑都属于正常现象。
一般痣上长毛反而表明色素痣是良性，如果色素痣发生恶变侵袭周边组织，破坏局部正常结构，包括局部毛囊结构，可能都会被破坏，这样就不会出现痣上有毛发生长。通常痣上长毛相对更加稳定，发生恶变概率更低。
