儿童布地奈德的副作用较明显，因为布地奈德属于肾上腺糖皮质激素，可损伤局部免疫力。布地奈德出通常采用雾化吸入，虽然也可以局部涂抹，但儿童通常会采用雾化吸入的方式，可以使雾化过程中的通道，如口腔、鼻腔、呼吸道的免疫功能下降。
因为人的口腔、鼻腔、呼吸道，都有局部免疫反应，都有局部的分泌型IgA的出现。因为布地奈德具有抗炎功效，可能会抑制分泌型IgA的产出，影响到局部免疫功能。所以儿童经常做布地奈德雾化，易出现鹅口疮以及口腔霉菌的感染，严重时可以出现呼吸道深部的真菌感染。所以小儿布地奈德虽然对治疗喘息的治疗效果较好，可以治疗较多疾病，而且全身的副作用比较轻，但存在局部副作用。所以建议在有指征的情况下，充分评估可能带来的副作用，然后应用小儿布地奈德。
