打喷嚏时有恶臭比较常见，多数和口臭有关。口臭的常见原因包括有牙龈炎、牙结石、口腔卫生不良导致，所以治疗首先建议到口腔科，对牙结石进行适当地刮治，牙龈炎进行适当的治疗，如果有牙髓炎、根尖炎都要适当治疗，解决口腔的严重问题。
在每次吃饭后都要刷牙，经常漱口，一般就可以解决口臭的问题，从而对于打喷嚏有恶臭也有减轻作用。
另外打喷嚏有臭味和反流性食管炎、反流性咽喉炎有关系，病人往往会存在胃肠功能不良，有反流长期存在，打喷嚏有臭味和胃内容物的气体通过嗳气、打嗝、恶心等食管的运动输入到咽喉，打喷嚏时就会将其喷出，就会有因为消化不良产生的气味。
另外有可能和长期吸入污染空气有关系，因为吸入的污染物沉积在肺部，通过打喷嚏之后排出，就会产生一定的臭味。
