感染性心内膜炎手术换瓣之后的效果与术前患者的总体情况有很大关系，若患者术前感染比较重，患者整个身体机能出现衰竭，可能会因为感染问题引起其它器官功能障碍，比如出现肝功能异常、肾功能异常，甚至脑栓塞等并发症。
若手术后把心内感染灶祛除掉，换上好的瓣膜，患者的血流动力学会得以改善，但这类人群可能恢复比较慢。
若感染毒力比较强的细菌，术后在抗感染的过程中若无法通过药物彻底将体内病原菌杀灭，血内致病菌可能会附着在瓣周组织上，引起瓣周感染，使患者出现瓣周瘘甚至瓣周脓肿，这类患者需要再次处理瓣膜问题。所以手术效果怎么样，主要是根据患者感染的具体情况决定，手术本身并不是最主要的问题。
