肚子咕咕叫主要是胃肠道蠕动活跃导致，病因上可分为器质性和功能性两大类，具体如下：
1、功能性病变：功能性的最多见的是肠道生理状况下肠道蠕动较快，有可能是饥饿的前期。第二，肠易激综合征在发作时，不仅肠道功能受损，而且还会存在蠕动亢进的现象，肠道中的水分和气体，在肠道蠕动的过程中，会发出咕咕叫的声音。第三，肠道菌群紊乱，当人体存在肠道菌群失衡时，肠道中的不良菌群会与食物残渣发生反应，产生气体，这些气体在食糜中穿行，就会引起咕咕叫的声音。第四，进食大量产气的食物，比如红薯、白萝卜、豆腐等，及一些不易消化的高脂肪、高蛋白的食物，可以导致消化不良症状的出现，也会引起肚子咕咕叫的情况；
2、器质性病变：主要见于肠梗阻、急性肠炎、炎症性肠病、胃肠道肿瘤、胃肠道溃疡、肠结核、肠道寄生虫病等，病理状态会导致肠道炎症渗出物增多，刺激肠道蠕动加快，出现病理性的改变，尤其肠梗阻在发作时，由于肠道梗塞，致使上边的内容物不能及时向下排出，导致肠腔过度扩张、食糜堆积，也会引起肠鸣亢进、肚子咕咕叫的现象。
