癌胚抗原正常不能排除癌症，因为癌胚抗原其特异性和敏感性都不是100%。以结直肠癌为例，在已经诊断结直肠癌的患者中，癌胚抗原的阳性率，即癌胚抗原增高的患者，比例可能也就占所以患者的40%左右。
另外还有一类患者，虽然其癌胚抗原增高，但其不是肿瘤病人，此类患者的癌胚原增高得通常不多，而且会长期处于轻度增高的趋势。通常建议此类患者做定期的肿瘤标志物复查，只要不存在进行性增高的趋势，就没有必要过分担心。假如出现癌胚抗原异常增高，甚至是进行性增高，从普外科医生的角度进行考虑，建议一定要让患者做相应的胃肠镜检查，以排除是否有结直肠癌或是胃癌。
