早孕女性左侧附件区有囊肿，其原因具体如下：

1、黄体囊肿：通常若在孕前曾做过B超检查，没有发现左侧附件区有囊肿，而在怀孕之后发现，通常可能是黄体囊肿。此类情况不用给予治疗，也不用干预，通常此类囊肿的直径会＜5公分，临床也没有其他不舒服的症状。因此，建议女性定期到产科做产检；

2、其他囊肿：若在孕前没有到医院做过检查，出现左侧附件区有囊肿，并且囊肿的直径相对较大比如5公分或更大。此时就有可能是因为巧克力囊肿，即子宫内膜异位症所导致。另外，也有可能是黏液性囊肿或卵巢局部的浆液性囊肿等。此类情况就需要动态观察，暂时可以考虑不做手术治疗，但要做妇科肿瘤标注物的化验检查，了解是否有恶性变的可能性。若有恶性变需要终止妊娠，并且需要尽快考虑进行手术治疗，若没有恶性变则可动态观察，在足月分娩时可以考虑做剖宫产分娩，同时将左侧附件区的囊肿给予手术剔除。