牙疼和扁桃体疼有可能是引起了急性牙周炎，或者是急性扁桃体炎，常常在机体免疫力低下的情况下，细菌、病毒趁机侵犯，而引发局部的炎症。急性扁桃体炎，最常见的致病菌是乙型溶血性链球菌，而牙周炎最常见的致病菌有时是厌氧菌。如果二者同时发生，有可能是互为影响，建议一定要前往当地医院的耳鼻喉科门诊就诊，明确诊断。
首选的治疗是药物治疗，尤其是抗生素的治疗，首选药物有青霉素类，如阿莫西林，或者是头孢类，如头孢克肟、头孢克洛，必要时可以加用抗厌氧菌类的，如甲硝唑。具体给药方式，一定要根据患者局部以及全身症状而定，是口服给药还是静脉给药。
而部分急性扁桃体炎的患者，如果存在高热，或者是局部疼痛比较严重，也可以考虑口服解热镇痛类的药物，如布洛芬。或者是全身酌情应用糖皮质激素，如甲强龙即注射用甲泼尼龙琥珀酸钠，也能有效地减轻局部以及全身的症状。如果局部疼痛比较明显，也可以考虑复方硼砂溶液漱口，或者是局部应用布地奈德混悬液雾化吸入，也能有效地减轻局部的症状。
