甲状腺功能低下引起的原因，一是碘缺乏，二是甲状腺激素合成分泌的场所受到了损伤，使得甲状腺激素，没有场所合成，而发生甲状腺功能减退症。

1、缺碘：甲状腺功能低下比较少见，因为在这类地区已经在盐中加有了碘剂，所以地方性甲状腺肿造成的甲状腺功能减退症的发病率大幅度下降，也就是常说的大脖子病；

2、甲状腺激素合成分泌的场所受到了损伤：由甲状腺疾病导致的甲状腺激素合成、分泌减少的场所，导致的甲减比较多见。常见的有桥本氏甲状腺炎。桥本氏甲状腺炎是甲状腺的自身免疫性疾病，机体把甲状腺当做抗原，产生的自身抗体，随着病变的进一步发展，淋巴细胞逐渐代替了甲状腺细胞，致使甲状腺组织逐渐减少，发生甲状腺功能减退症。其次可见于核素碘-131治疗弥漫性甲状腺肿伴甲状腺功能亢进症以及甲状腺癌时，甲状腺细胞被核素碘-131所破坏得过多，产生甲状腺功能减退症，还可见于甲状腺手术以后，切除了一部分甲状腺组织，而发生了甲状腺功能减退症，而用下丘脑垂体病变所导致的甲状腺功能减退症，比较少见。