碘伏很温和，可以冲洗阴部，是可以用于皮肤和黏膜的消毒剂，经常用于术前准备及术中皮肤黏膜的消毒。妇科手术中，如人流、清宫、阴道壁手术、宫颈手术 、锥切、宫腔镜检查、经阴道子宫切除等通过阴道途径的手术，都可以使用碘伏。碘伏温和且对黏膜没有刺激，患者能够耐受。
碘伏对于阴道炎，可以起到治疗的作用，但不建议使用。因为碘伏对于阴道里的所有细菌，包括有益菌、有害菌，都可一同清除。而阴道里的菌群，最主要的部分是乳酸杆菌，这是有益菌。经碘伏消毒后，有益菌和有害菌全部消除，微生态平衡被破坏，重新建立需要一定时间。
