骨髓移植危险期定义有所不同，一般移植后1年才安全。骨髓移植的早期、中间、后期危险度有所不同，在移植中可能因为骨髓抑制、白细胞低而出现感染，所以此时相当危险，包括肝、肾、心脏对大剂量的化疗有相应的反应和副作用，而出现相应的器官衰竭，所以危险性很高。
移植后3-6个月，此时病人免疫力逐渐恢复，但更常见的还是感染、排异反应，包括急性排异反应和慢性排异反应，是影响生存的重要副作用，基本在3个月后，病人复发、危险性在移植病人中逐渐占主要地位，所以在3个月到1年内更要警觉白血病复发。在半年内一般会停用抗排异药物，则半年后感染机会会有所下降，期间每个月都要血象检查、骨髓检查，一年后再逐渐减检查的频度，但总体要3年、5年的长期观察、持续监测，到5年后才可达到治愈。
