儿童患甲状腺功能亢进，多数能够达到临床治愈水平，只有极少数患者可能控制效果不好，最终需要手术治疗。通常儿童甲状腺功能亢进，在临床上首选口服药物治疗，依从性较好，且副作用较小。虽然药物治疗能够完全控制甲状腺功能亢进的症状，但也有部分患者可能会出现复发，且复发率能够达到40%左右。
除口服药物外临床上还可以选择给予碘131治疗，与口服药物相比复发率较低。此外对于顽固性甲状腺功能亢进，可采取手术治疗，但通常不建议采纳。因为儿童还处于生长发育时期，需要保持甲状腺功能，一旦甲状腺切除之后需要长期口服甲状腺素，以维持甲状腺功能。通常临床上甲状腺功能亢进的治疗疗程在2年左右，在口服药物的过程中，需要定期复查儿童的肝脏功能，以及血常规，及时避免药物可能出现的副作用。
