一咽口水耳朵疼的原因有以下几种：

1、急性鼻咽炎：鼻咽部有咽鼓管的咽口，咽鼓管连接鼻咽部和中耳腔，如果有急性鼻咽炎，如感冒后在吞咽口水时，即咽鼓管开放时感染源从鼻咽部进入到咽鼓管、中耳腔导致中耳炎，因此吞咽口水、咽鼓管开放时有气体介入中耳腔，就会导致耳朵疼痛感。如果疼痛没有持续加重，在1-2天内逐渐缓解，说明问题较小，无需药物治疗，如果疼痛在2天逐渐加重，甚至听力下降，出现发烧的情况，说明有细菌感染，需要使用抗生素进行治疗，如阿莫西林克拉维酸钾。

2、反流性咽喉炎：另外咽鼓管功能紊乱、咽鼓管炎，有时经常与胃酸、胃液反流刺激导致反流性咽喉炎有关。胃肠反流可以刺激鼻咽部，即咽鼓管的开口，从而导致咽鼓管炎以及中耳炎，吞咽时会有一定耳朵痛的情况，需要用抑制胃酸的药物减少胃酸反流刺激，才会逐渐改善耳痛的症状。但该因素经常被忽视，因为较多患者没有反酸的感觉，因此碰到该情况时需要注意反酸的感觉，必要时使用抑制胃酸的药物进行治疗，才能逐渐取得较好疗效。