睡醒了头疼，一般跟身体反应有关。睡觉时血流速度缓慢，睡醒后一过性的激素水平变化，导致血管扩张或收缩，出现头疼症状。这种情况一般容易缓解，如果短期内不能缓解，考虑是器质性问题。
有些是因为睡觉时受凉，造成神经痛，要针对神经痛进行治疗。还有部分是睡醒后出现血压波动，叫晨峰高血压，这种情况下会出现头疼，要治疗高血压。
其他原因造成睡醒头疼，如偏头痛，刚醒过来造成一过性的血管收缩和舒张功能的障碍，容易诱发偏头痛发作，也会出现头疼症状，可以给予扩张血管的药物进行治疗。
还有紧张性头痛，因睡眠质量欠佳，长期紧张状态，睡醒后出现头绷紧、头胀的感觉。要给予放松头皮肌肉、改善睡眠的药物，可以改善这种症状。
另外就是大脑病变，造成大脑缺血、缺氧或低血糖，也会在睡眠中出现血流速度缓慢，加重缺血、缺氧的状况，和低血糖发生，出现睡醒了头疼的症状。
