单纯疱疹病毒感染的临床症状可以自愈，但病毒感染本身通常无法自愈。单纯疱疹病毒感染的临床表现即为单纯疱疹，主要为相对局限性的红斑基础上，出现簇集性水疱。患者会有疼痛、麻木、灼热感，经过治疗或者不治疗，水疱可以逐渐收敛、干涸、消退。所以单纯疱疹病毒感染导致的单纯疱疹，临床症状可以自愈，通常需要1-2周。
但在临床症状自愈的情况下，疱疹病毒会在感染的神经节段长期潜伏。当人体免疫力处于下降的状态时，如过度劳累、熬夜或者合并肿瘤，或者使用抑制免疫系统的药物，如激素和免疫制剂，或者有重大的手术、创伤、精神刺激，导致免疫功能下降，单纯疱疹病毒就可以在神经节包括神经轴突内继续繁殖。从而在皮肤表面再一次出现单纯疱疹症状，再次表现为红斑基础上的簇集性水疱，局部的灼热、疼痛，或者一定的麻木感。所以临床上建议单纯疱疹病毒感染患者，在出现单纯疱疹的临床症状时，积极进行抗病毒治疗，减少病毒的载量，从而减少病毒复发的概率。
