如果父母染色体异常，建议患者做遗传咨询。染色体异常分为常染色体异常、性染色体异常、基因片段异常等，可能会导致不孕、孩子畸形、孩子染色体异常。如常染色体异常可能导致红绿色盲，或21-三体综合征、18三体综合征等智力问题，还可能导致心脏、肾脏等器官畸形，如法洛四联症、多囊肾等。
染色体异常的父母，通常有不良孕史，如胎停育、自然流产史、孕中期胎死宫内等。此时建议夫妻双方检查染色体是否异常并做遗传咨询，如咨询是否适合再生孩子、若再生孩子会有什么严重的后果、是否需要做第三代试管婴儿等。若做第三代试管婴儿，可以生出没有染色体畸形、器官畸形、智力问题等相对健康孩子。
