鼻炎的上颚疼痛是由于鼻腔里面的分泌物向鼻咽部倒流，经过鼻咽部再流到口咽腔会造成上颚疼痛。因为鼻炎的分泌物里面通常会含有病毒、细菌，特别是鼻炎合并细菌感染引起急性鼻窦炎或者慢性鼻窦炎发作时，分泌物通常为脓性，里面会含有大量的细菌和坏死的细胞，这样会引起鼻咽部和上颚的炎症，因此鼻炎发作时上颚疼痛是经常会出现的事情。
一旦鼻炎发作在引起上颚疼痛前，便应该使用鼻用减充血剂或者是鼻用的糖皮质激素，控制鼻腔分泌物的倒流，减少鼻腔分泌物对于鼻咽部和上颚的刺激。由于鼻腔的通气引流改善之后，也会减少鼻窦炎的发生。
如果急性鼻窦炎已经出现，已经有脓鼻涕、鼻塞伴有上颚疼痛，这时需要应用抗生素进行治疗。急性鼻窦炎可以使用头孢菌素类抗生素，可以同时使用鼻用减充血剂加上黏液稀释剂进行规范化治疗。如果是慢性鼻窦炎可以使用大环内酯类抗生素进行抗炎治疗。
