激光治疗色素病变的原理基于选择性光热作用，抑制激光能量在极短时间内被病变中的色素颗粒包括黑色素小体、纹身、墨水等吸收产生极高温度，使其快速膨胀，形成微型爆破，产生汽化粉末状非常小颗粒，被组织内巨噬细胞吞噬清除。
激光对人体正常组织不产生损伤，或仅产生轻微可逆性损伤，而对病变组织产生不可逆损伤，表现出高度选择性，一般不会形成瘢痕。激光穿透深度有限，只能达到真皮，不会对深部组织造成损伤，只要避免直视激光束，不会对视力造成影响。激光并非射线，不会对机体造成辐射伤害。
激光祛纹眉、纹眼线后仍能长出正常的眉毛和睫毛。激光治疗色素性病变的适应症有太田痣、伊藤痣、雀斑、老年斑和日光斑、咖啡斑、纹身、纹眉、纹眼线、纹唇、褐青色痣、黄褐斑、炎症或外伤后引起的色素沉着，非适应症有不能耐受手术者，其危害跟激光祛斑风险相同。
