通常女性在肛瘘术后40天左右可同房。因肛瘘手术后可有创面，此创面完全愈合最快需四周左右，在伤口愈合后可进行正常的排便、排尿或性生活。

肛瘘手术相当于将整个盆底肌肉的协调功能打乱，若较早进行性生活，可影响患者的感觉，甚至可对心理层面、精神层面造成影响。