斑秃的头发大多数毛囊并没有坏死，而处于一种休眠状态，没有进入毛囊的生长期。所以治疗斑秃应该内外结合，激活毛囊，使毛囊重新进入健康生长的状态。所以为此研发出来药物，比如改善循环的药物，临床中最常用的西药是米诺地尔，是扩张血管的药物，改善毛囊的血液供应。还有中药制剂，大部分中成药通过涂抹使局部产生轻微的刺激炎症反应，使局部循环加快、血液供应加强，也会促进毛囊生长。斑秃是自身免疫性炎症性皮肤病，虽然表面观察和正常皮肤没有区别，但是实际上在皮肤里有着汹涌澎湃的炎症，所以用外用激素药膏或者免疫抑制剂药膏，比如地奈德乳膏或者他克莫司乳膏，通过涂抹使炎症得到控制，是外用的方法。
其次，斑秃和免疫相关，所以用增强免疫力药，比如胸腺肽、转移因子。还有中成药，如调节神经、安神补脑、舒缓神经、改善睡眠的药物辅助治疗，帮助斑秃恢复。
