做胃镜通常很难受，需通过食道观察食管、胃、十二肠，一般10-20分钟能够完成胃镜检查，若进行活检或其他治疗时会相应延长检查时间。有些病人耐受力较好，做胃镜时，恶心、呕吐、腹胀等症状较轻，通常能顺利完成检查，有些病人平常抽烟、喝酒，有咽炎，常出现严重恶心、呕吐等症状，在整个胃镜操作过程中会较难受，也会影响观察者进行有效观察。
做无痛胃镜时，由于病人处于麻醉、松弛状态，能够顺利、无痛苦完成胃镜检查。做无痛胃肠镜检查前需评估患者心肺功能，若有心脏病或支气管哮喘，通常不能检查，否则会诱发心肺疾病，甚至危及生命。
