窦性心律不齐可以分为生理性和病理性。生理性窦性心律不齐可以恢复的。比如呼吸性窦性心律不齐，常见于青年人或者运动员，一部分青年人年轻时存在窦性心律不齐，随着年龄增长、呼吸方式改变，窦性心律不齐可以消失，也可以说是自愈，但为生理性变化。
病理性窦性心律不齐，主要看该病病因如何。如果引起窦性心律不齐的病因是可逆的、可去除的，比如电解质紊乱、药物短暂影响，窦性心律不齐可以自愈。但是引起窦性心律不齐的病因是器质性病变，比如冠心病、心肌缺血、心梗损伤，则不会自愈。所以窦性心律不齐由不同原因导致，所以情况和结局是不同的。患者不能因为存在生理性的窦性心律不齐，就认为所有的窦性心律不齐都可以自愈，而不去就诊，延误治疗时机。
