男性肚子疼可以挂消化内科、普通外科、胃肠外科，部分大型医院分科比较精细，如胃肠外科、结直肠外科。上腹疼痛可以去胃肠外科，右侧上腹部疼可以去肝胆外科，下腹部疼可以在结直肠外科或肛肠外科就诊。
如果是急性的腹痛，剧烈、持续性的疼痛，腹痛难忍，可以挂急诊科，急诊科会根据肚子疼的情况请相关科室的会诊，例如急腹症就是肚子短时间内持续的剧烈疼痛，可以挂急诊外科，急诊外科可能会请肝胆外科、胃肠外科或结直肠外科进行会诊，明确诊断，根据病因择科住院治疗。如果是非持续性轻微的疼痛，也可以自己到门诊挂消化内科、胃肠外科、结直肠外科就诊。
