子宫腺肌症有一定的怀孕机会，但怀孕机会可能会下降。不是所有的子宫腺肌症患者都无法怀孕，如果子宫腺肌症的病灶不多且不明显，仍然有怀孕的机会，也有多数女性可以妊娠、分娩。部分女性可以通过辅助手段，使病灶缩小后再怀孕，如通过GnRH-a类药物或手术使子宫缩小，待子宫恢复后再怀孕也可增加怀孕概率。

子宫内膜在正常情况下应该在子宫内，不会外移至子宫外，子宫腺肌症是子宫内膜内陷到子宫肌层内，子宫肌层内的子宫内膜仍然有一定的活性，可以随月经周期、雌孕激素的变化而变化，所以也会出血。出血则形成出血灶，逐步发展使子宫肌层出现较多出血点，从而破坏肌层，使肌层的弹性变差，出血灶、子宫增大都可影响怀孕，对怀孕的影响是不易怀孕。子宫内膜可能反复出血而导致炎症发生，子宫内膜容受性不良、影响着床，从而影响怀孕，部分女性怀孕后因为子宫弹性不良、炎症因子而容易流产，时期更晚则因为子宫弹性变差而容易早产。