三次胚胎停育可以诊断为反复复发性自然流产或习惯性流产，此时建议夫妻双方到生殖医学中心就诊，进行全面检查。
首先会排查是否有遗传方面的因素，夫妻双方查染色有无问题。如果在既往胚胎停育过程中，有机会查到胚胎染色体时，会提供更多信息，因为胚胎停育的原因大致上可以分为胚胎因素和母体因素。
其中胚胎因素就要观察胚胎染色体是否正常，通常染色体不正常的胚胎也会自我淘汰，极少数能撑到活产。
除前面提到的染色体检查或遗传因素外，还要考虑有无其他因素，如有无内分泌因素的存在，建议在月经期的时候抽血查看卵巢功能如何，有无其他激素如甲状腺激素的严重异常等。
此外黄体功能如何，可以在排卵后第七天时抽血，查看黄体产生的雌孕激素水平，上述也是导致胚胎停育的原因。另外，凝血、免疫、感染、解剖因素等均是导致胚胎停育的原因，分别根据上述原因做相应检查。
通常在生殖医学中心就诊时，可以进行检查完成上述因素的筛查，尽可能找到胚胎停育的原因，帮助患者在后续过程中能顺利怀孕，以及能有健康的活产。
