第三代试管婴儿有一定的医学指征，是因为为排除某些遗传性的疾病，包括是父母双方有一方的染色体有着平衡异位，或者其它的异常情况，或者是目前能够检测到的单基因遗传病，可以通过探针检测排除掉，这种情况下需要做第三代试管婴儿。

目前，不是所有的遗传性的疾病都能够检测到。所以，如果现在条件上能够制造出探针的情况下，可能建议做第三代试管婴儿来排除，这是优势。所以，能够回避遗传性疾病的风险。

缺点就是需要大量的胚胎去筛选，因为目前第三代的试管婴儿，需要把胚胎养成到囊胚的阶段，不是所有的卵形成受精卵之后，都能够发育成囊胚。在受精卵发育成囊胚的过程中，尤其是在体外培养中淘汰率很高。医学上有文献报道数据上统计，42岁以上的女性可能需要15个卵左右，才能形成一个正常的囊胚。如果在30岁左右时，可能需要7-8个卵，才可能有一个正常的囊胚。所以，平均算下来，如果30岁的女性能够取到15个卵，形成一个正常囊胚的概率并不大，何况在过程中还有异常的情况，也就是在做第三代时，需要非常多的胚胎足够筛选。

另外，目前做第三代试管婴儿，做囊胚的筛选的费用也非常贵。所以，面临的问题就是可能养到最后没有足够多的胚胎进行筛选，或者筛选出来胚胎可能不满足条件的情况下，但是又花费非常多的金钱。还有一种情况就是反复流产，建议去做移植前的筛查，筛查又有一定的假阳性和假阴性，不是100%的准确。也就是可能会把好的胚胎筛掉，把不好的胚胎筛进来，而且又增加病人的负担。所以，要具体情况具体分析，根据个人的情况，优势很明显，也有不足的地方，即筛选率低，而且费用上又非常的贵。所以，根据自己的经济情况和卵巢功能上，综合判断。