药物流产不干净主要表现为流血时间较长，普通药物流产孕囊排出后，流血时间不超过2周。如流血超过2周，需考虑药物流产未净、宫内残留情况，建议及早至医院行相关检查，如B超检查、检查血HCG，排除宫内残留现象。

如果检查后明确宫腔内存在残留物，应及时进行清宫处理，以免残留物于宫腔内停留时间过长，引起宫腔感染，影响子宫复旧。