滴虫性阴道炎治疗的药物主要是甲硝唑，通过甲硝唑口服全身用药结合阴道局部用药的方法来进行治疗。因为甲硝唑对于胃肠道会有一定的刺激作用，有时会引起恶心、呕吐的现象，所以在饭后服用会减少这样不适的症状。一般是口服7天为一个疗程，同时阴道使用的药物是甲硝唑凝胶，也是连续7天一个疗程，一个疗程结束在停药3-7天以后要进行阴道炎的复查。
因为滴虫性阴道炎是由于外来感染所引起，绝大多数都是通过性生活来传染，属于性接触疾病的一种，因此对于患有滴虫性阴道炎的女性，性伴侣也要同时给予治疗，性伴侣治疗的同时如果有其他的性伴侣，仍然要同时治疗。所以女性在进行性生活的时候还是要尽量保护好自己，最好采取一些隔离措施，也就是避孕套，在避孕的同时有效保护女性，避免发生一些外来因素的感染。
