血清低密度脂蛋白胆固醇偏低，本身是胆固醇的一种，常见还是血清低密度脂蛋白胆固醇偏高人群。如果是偏低，需要找到原因，是什么东西导致血脂消耗增加，或血脂合成减少。低密度脂蛋白胆固醇主要是在肝脏合成，如果有肝脏慢性疾病，如肝硬化或慢性酒精性肝病，都可以导致低密度脂蛋白胆固醇合成减少，从而使血里胆固醇降低。

另外，如果长期素食，油脂摄入减少，也可以使低密度脂蛋白胆固醇偏低。还有人有内分泌疾病，如甲状腺功能亢进症。甲状腺激素是全身性代谢激素，可以使脂肪燃烧增加，可以使低密度脂蛋白胆固醇降低。使用他汀类降脂药的患者，如误用他汀类降脂药，可能也会导致低密度脂蛋白胆固醇降低。还有自然界也有天然他汀类物质，如红曲米，如果长期摄入红曲米，也可能会导致低密度脂蛋白胆固醇偏低。