卵巢囊肿多大需要手术并不是一个固定概念，一般5cm以上的卵巢囊肿大多数需要手术，但是在临床上也发现过生理性卵巢囊肿也可能长到5cm以上。生理性卵巢囊肿指在排卵期两次月经之间，下次来月经之前的14天左右，即排卵期排卵之后往往形成一种卵巢的黄体囊肿，大多数发生在月经后半期，等到月经结束以后，囊肿会自行消失，所以生理性囊肿不需要进行手术。

生理性囊肿大多数是在5cm以下，但是也曾经发生过5cm以上的生理性囊肿，生理性囊肿的超声表现是在附件区有一个单纯的无回声区。所以如果发现附件区有单纯无回声区，没有其他异常回声，而囊肿又是在月经后半期出现，先不急于进行手术，即使囊肿在5cm以上也可以暂时观察。一般经过2-3个月的观察，如果囊肿仍然不消退，建议进行手术治疗。而对于卵巢的子宫内膜异位囊肿，即使没有达到5cm，如果引起了腹痛、痛经或者不孕症等临床症状，仍然也可以进行手术治疗。