鼻咽癌病理诊断的报告内容主要包括鼻咽癌病理类型，也就是鼻咽癌的病理分型，包括角化型鳞状细胞癌、非角化型鳞状细胞癌和基底样型鳞状细胞癌。
角化型一般又分为高分化、中分化和低分化，常见的鳞状细胞癌一般伴有角化。而非角化型一般分化比较差，没有明确角化，在形态上可能不太容易判断是否是鼻咽癌。所以这类患者通常会加做免疫组化。基底样型鳞状细胞癌是一种比较少见的特殊类型，一般分化很差，而且增殖指数，即Ki67比较高。病理报告中看到的主要是鼻咽癌分型。
此外，临床还会进行特殊免疫组化，比如EB病毒染色，主要因为EB病毒和鼻咽癌有很高的相关性，尤其是非角化型鳞癌，几乎100%都伴EB病毒感染，所以进行该项检查可以提示临床，针对该病毒进行治疗。