阴囊囊肿这种表述不是很规范，在临床上更常见的囊肿主要是位于附睾头部，部分患者可能会有精索部位的囊肿。附睾是非常重要的性腺，有大量的液体排泌功能，是精浆来源很重要的组织器官。
当附睾局部出现一些微小病变，尤其是早期出现一些感染性炎症病变的时候，会导致性腺的腺体内部排泌小管出现狭窄，出现梗阻性问题，就会导致精浆排泌出现梗阻、出现困难、出现障碍，逐渐就会形成很小的微小水疱，潴留性的精浆病变。
随着时间的推移，精浆的囊肿会越长越大，最后就会形成影像学上可见的囊肿，甚至患者可以通过查体的形式触摸到囊肿。一般临床上小体积囊肿，不需要进行专门的特殊治疗。
但是对于体积超过3cm的附睾囊肿，由于有潜在的感染风险，大体积囊肿会对日常行动、生活、工作造成一定的影响。所以这时候可以考虑给患者做囊肿的切除手术，手术非常简单、创伤非常小、恢复也非常快。
