卵黄囊瘤的肿瘤学标志物是甲胎蛋白，甲胎蛋白较为特异，临床上可帮助诊断卵黄囊瘤，常见关系如下：

1、甲胎蛋白是诊断卵黄囊瘤的重要依据，如果骶尾部卵黄囊瘤患者出现大小便障碍，影像学检查显示局部有浸润以及全身转移病灶，且甲胎蛋白较高，有几十万，甚至上百万的情况下，可进行临床诊断，因此甲胎蛋白是诊断的重要依据；

2、甲胎蛋白是观察卵黄囊瘤治疗疗效的重要指标，肿瘤细胞活性越高，分泌的甲胎蛋白产物越多，即甲胎蛋白越高，说明肿瘤细胞活性越强，经治疗后如果甲胎蛋白呈指数下降，说明治疗较为有效；

3、甲胎蛋白是判断卵黄囊瘤患者预后的指标，如果甲胎蛋白增高，不超过100μg/L，说明预后较差；

4、甲胎蛋白是判断卵黄囊瘤复发的重要依据，患者治疗结束后，随访观察中甲胎蛋白有升高的情况，要警惕经常出现上述情况的患者，需要进行动态观察。如果甲胎蛋白持续增高，提示有肿瘤复发的可能，需进行相应的影像学检查，寻找是否存在复发灶。