纤维喉镜与电子喉镜主要区别是呈现硬件系统的区别，两者均为软镜，其检查方式一般均经鼻、口完成，手术操作方式均一致，主要区别在于成像区别，纤维喉镜是比较早期的喉镜、软管镜，其检查呈现还不是特别清楚。

电子喉镜由于硬件改善，能够观察较细微的病变，尤其结合相关技术，比如窄带技术，能够辨别早期喉癌与一般炎症区别。因此，对于部分比较复杂的疾病，比如早期喉癌、下咽癌，以及部分黏膜病变，即声带黏膜病变，会优先选择电子喉镜以及相关技术，包括窄带技术等。而纤维喉镜没有电子喉镜这一系列功能，所以对于部分大型医院，均常规采用电子喉镜。