细菌感染和病毒感染在临床上会有区别，但是一般情况下，作为普通老百姓，可能很难辨别，细菌是细菌的感染，病毒是病毒的感染。同样都是感染性疾病，一般情况下都会有发热，如果是肺部细菌感染、病毒感染，或者消化道细菌感染和病毒感染，都会有相应症状和体征。如果是呼吸道感染，有咳嗽、咳痰、胸痛；如果消化道感染可能腹痛、腹泻等表现都可能有，有些不一样。如果是病毒性的肺炎，脓痰可能相对要少；如果是细菌感染脓痰可能相对多。腹泻，细菌感染脓血会多，病毒感染脓血可能相对会少，但都不是绝对的。
还有通过化验检测证实，比如血象中性粒细胞升高、白细胞升高是细菌感染。但也不一定，病毒感染可能出现白细胞升高或者中性粒细胞升高，所以单纯血象变化不是绝对的。除此之外还有C反应蛋白、降钙素原等检测支持是细菌感染或者病毒感染鉴别，所以临床症状是最弱的鉴别手段，重要的是实验室检查。