直肠和肛门是下消化道的最外侧，一般出现了下腹部坠胀、疼痛和肛门疼痛异常或者排便异常时，通常考虑是肛门疾病和直肠疾病。在诊断这两个部位的疾病时，先考虑的检查项目可能是肠镜。肠镜可以明确看到直肠内的相应病变，比如直肠的恶性肿瘤、息肉、炎症、溃疡，皆可以发现。

在肠镜插入肛门的时候，可能直接略过肛门，从而无法直观检查肛门部的病变，比如痔疮、肛裂，以及肛管的炎症、肛窦炎，这些通过肠镜不易诊断。如果要检查肛门部的疾病，一般建议做肛门镜的检查，而肛门镜是专门检查肛门、肛管部位的疾病。