百日咳是由百日咳杆菌引起的急性呼吸道传染病，针对百日咳的治疗首选大环内酯类的抗生素，例如红霉素、阿奇霉素，或者克拉霉素。在咯痰期即时应用大环内酯类的药物，可以预防痉咳的发生。
进入痉咳期后应用抗生素并不能够缩短百日咳的临床过程，但可以缩短排菌期，预防继发感染的发生。除了应用大环内酯类的药物来进行抗菌治疗之外，对于百日咳的症状还可以进行对症治疗。
例如痉咳可以应用镇咳治疗，痰液黏稠的时候可以应用雾化排痰的治疗，这样帮助患儿痰液排出。另外，还可以应用镇静剂来解除患儿的恐惧等症状。
所以总体来说百日咳的治疗需要应用抗菌药物，而抗菌药物首选的是大环内酯类的抗生素。除了抗菌药物的应用，还可以进行对症治疗，另外还可以进行一般治疗，即要对患儿的饮食、起居进行有效的管理。
