支原体肺炎患者存在咳嗽、咳痰的症状，肺部有干啰音、湿啰音。轻症患者有时可以自愈，治疗则以药物治疗为主。由于支原体没有细胞壁，通常使用青霉素、头孢菌素、β-内酰胺类抗生素对支原体肺炎并无治疗作用。但阿奇霉素等大环内酯类抗生素，以及左氧氟沙星、莫西沙星等喹诺酮类抗生素对支原体肺炎治疗有效。

衣原体肺炎的发病率相对较低，患者胸部影像学可以见到大片状渗出影，治疗及抗生素选择与肺炎支原体并无区别。但病情有时较为凶险，患者会出现呼吸衰竭等并发症，所以需要维护患者脏器功能，比如纠正呼吸衰竭、电解质紊乱。