胆管肿瘤存在良性情况，肿瘤分为良性和恶性，但是一般医学上良性肿瘤称作瘤，恶性肿瘤一般称为癌或肉瘤。因此胆管肿瘤既有良性，又有恶性，恶性胆管肿瘤如胆管癌，它是发生在胆管上皮的恶性肿瘤，胆管良性肿瘤包括胆管壁囊肿、胆管壁腺瘤等。

医学上的胆管肿瘤都有可能发生阻塞胆管、梗阻性黄疸，因此临床上胆管的良性肿瘤和恶性肿瘤表现较类似，都会引起梗阻及黄疸。但医学上恶性肿瘤具有禁忌性，还需要更丰富的血供。术前通过CT、核磁共振等检查，大部分可以区分胆管肿瘤的良、恶性。胆管良性肿瘤，通常需要手术切除，但和恶性肿瘤不同，恶性肿瘤需要切除的范围更广泛。