口腔消毒要根据患者口腔疾病的情况，给予相应不同的治疗，包括药物治疗。如果是口腔外伤的患者，一般来说多选用酒精，即75%的酒精进行消毒。另外，对于口腔外伤的患者还可以用0.5%的碘伏，也就是活力碘进行相应的口腔消毒。
对于口腔手术患者，一般多选用0.5%的活力碘进行口腔的消毒。对于患有牙周炎以及牙龈炎的患者，可以用双氧水和生理盐水交替冲洗发炎的牙龈，然后进行碘甘油的涂抹，从而将口腔的炎症进行彻底祛除，起到消肿止痛的目的。
另外，如果是牙髓炎以及根尖周炎的患者，需在局麻下进行开髓引流，然后再给予相应的丁香油水门汀进行安抚镇痛，还可以给予CP进行消毒。根据患者不同的疾病的情况以及口腔的实际炎症程度，而给予相应不同的治疗，应用不同的药物进行相应的处理。
