肛瘘指在肛门处形成的反复感染病灶，起初是肛腺、肛隐窝感染导致，在抵抗力低下时形成肛周脓肿，肛周脓肿继发破溃或切开引流治疗后形成外口，若外口不能完全愈合，反复出脓、出血，此时就称为肛瘘。
肛瘘起初的病因多数是排便对肛门产生暴力导致，如便秘、腹泻撑破了肛腺、肛隐窝，导致粪便积存于此，当抵抗力低下时就容易出现肛周感染，肛周脓肿进一步加重、破溃就会形成肛瘘，肛瘘的治疗通常只有通过手术才能治愈。
通常根据肛周脓肿感染的部位及破溃后形成的瘘道位置，可将肛瘘分为四大类：
1、简单肛瘘：一个内口、一个外口以及一个中间通道；
2、复杂肛瘘：多个内口、多个外口，瘘道有交叉；
3、低位肛瘘：病损的位置较浅，靠近肛门、跨越肌肉较少；
4、高位肛瘘：病损位置很高，跨越肌肉较多。
