干眼症在临床上是相对较复杂的疾病，诱因较多，主要可根据眼表泪膜三层进行病因分类。较多见的是脂质层缺乏，该层缺乏可因睑板腺功能障碍导致，脂质层分泌不足，引起泪液蒸发过快，导致干眼症。
泪液中间为水样层，水样层缺乏可由先天性无泪症导致，还有类风湿或干燥综合征患者，都表现为泪液分泌不足。此外，内膜最底层是黏蛋白层，各种原因导致的杯状细胞减少或损伤都会出现黏蛋白层缺乏，如眼表化学伤或药物毒性反应，都会导致杯细胞减少或功能丧失，从而导致干眼症。
还可因眼睑异常，如外伤导致眼睑缺损、角结膜暴露，也易发生干眼症。部分病人因角结膜上皮异常，如角膜微绒毛异常导致泪液动力学异常，引起干眼症。此外，使用电脑、手机或长期看电视导致瞬目减少等视频终端综合征，也是产生干眼症的主要原因。
