畸胎瘤的误诊率不高，以卵巢畸胎瘤为例进行说明。通常结合临床症状，比如出现下腹部胀痛、下坠、痛经、月经失调、尿频，或者排便困难等，结合超声检查，会发现盆腔有占位性病变有可能边界清楚，也有可能边界不清楚，并且可能是囊实性回声，通常就可以作出初步诊断。
但究竟是良性，还是恶性，要结合妇科肿瘤标志物的检查进行分析。如果妇科肿瘤标志物检查，出现癌胚抗原、癌总抗原异常升高，超声检查边界不清楚，恶性程度有可能会明显增高。
但究竟是不是恶性，要在手术过程中，考虑做冰冻病理切片进一步诊断，等待半个小时结果出来之后，如果是恶性的畸胎瘤，需要扩大手术范围，所以畸胎瘤误诊率是不高的。一经作出初步诊断，要尽快考虑手术治疗。
