输尿管软镜是近十多年来治疗上尿路结石的一个新的微创治疗手段，它是通过人体的自然腔道，用一个很纤细的、软性的输尿管镜，配合激光设备，把上尿路结石通过粉碎甚至粉末化，变成很小的碎块，从而达到治疗目的，也是典型的微创治疗手段，其术后并发症主要包括以下几点：
1、手术中因为做软镜过程中要不断冲洗、灌洗水，如果灌洗水量过多，手术时间过长，压力过高，患者在手术中就有可能会出现泌尿系统感染的情况，甚至于会进一步发展，出现脓毒血症的情况，这也是比较严重的并发症；
2、手术当中如果不断灌洗水，肾脏压力过高，加上本身肾脏里有结石，是一个病理性肾脏，就会出现肾脏破裂的风险；
3、在放置输尿管鞘的时候，要用一个特殊的耗材，叫做输尿管软镜鞘，在放鞘过程当中有可能对输尿管黏膜有一定撕脱或损伤；
4、特殊部位的一些比较偏的结石，输尿管软镜没办法处理到，类似于肾下盏角落里的小结石，输尿管软镜没办法处理，这是手术当中容易出现的并发症。还有手术后并发症，一般出血风险相对比较少，和经皮肾镜取石术相比，它主要为感染，所以术后也要观察有没有出现泌尿系统感染的情况；
5、输尿管软镜过后的残石率，很多结石是通过激光变得非常小，但是并不代表所有石头都能够排出来，因为排石需要每个人剩余的压力和排石能力来决定，虽然石头打成粉状了，并不代表它就完全能够排出，所以残石也是输尿管软镜的并发症之一；
6、输尿管狭窄，如果做了软镜，留置输尿管鞘以后，有可能对输尿管黏膜有一定损伤，可能会出现输尿管狭窄。
但是这些并发症在输尿管软镜开展近十多年以来，在规范化后，其发生率也是比较低的。