女性患者月经后出现小腹疼痛的原因可能有以下几点：

1、充血：月经期间患者的盆腔和子宫会出现充血情况，会引起异常电信号放射并导致患者出现小腹的疼痛；

2、炎症：若患者合并有盆腔炎或子宫内膜炎，由于月经期间抵抗力相对较为低下，此时容易产生细菌并导致上行性感染，从而引起子宫内膜附件炎症。这时建议患者到医院进行血常规检测以明确血细胞、白细胞和CRP水平是否升高，必要时还可能需要进行妇科内诊明确是否有宫颈举痛、子宫区压痛等情况。若合并上述症状且血象较高，则需进行抗炎处理并口服或静脉注射药物抗炎、消炎；

3、子宫内膜异位症：若患者合并有卵巢巧克力囊肿、子宫腺肌症等子宫内膜异位症，则月经过后异位的子宫内膜剥脱性出血无法及时排出体外，而淤积的血液和内膜刺激机体会产生疼痛。

因此，患者月经结束后出现小腹疼痛的具体原因需要及时到妇科检查后进行综合性的判断和处理。