丙酚替诺福韦和恩替卡韦都是抗乙肝病毒的药，都可以在临床治疗中使用。丙酚替诺福韦是最近才出现的新型抗病毒药，优势在于疗效更好、耐药率更低，所以对部分有恩替卡韦耐药性的病人可以选择丙酚替诺福韦。另外，从疗效方面，恩替卡韦不如丙酚替诺福韦，丙酚替诺福韦的疗效更好、更快。
但是在临床上，上述药物都可以选用，已经选择恩替卡韦的患者继续用恩替卡韦进行抗病毒治疗。如果对恩替卡韦耐药，可以换用丙酚替诺福韦，也有部分患者对恩替卡韦、替比夫定、拉米夫定一类的抗病毒药都存在耐药现象，此时可以直接选用丙酚替诺福韦进行治疗。
