输尿管软镜是注入软镜腔，除了能够处理输尿管全程的结石，还可以处理肾内的结石。输尿管硬镜最多能够处理到肾盂的结石，主要是用来处理输尿管中下段结石。所以输尿管软镜处理的范围更广，而且处理效果更好，缺点是费用相对更高。
输尿管软镜对输尿管的大小有一定的要求，如果输尿管狭窄，就不能够使用软镜处理，或者仅能使用裸镜去处理输尿管或肾内的结石。输尿管硬镜是手术探查，可以处理整个输尿管，特别是输尿管中下段的结石，但输尿管上段的结石通常会移到肾内，这种情况输尿管硬镜不能够顺利地把输尿管上段或肾盂结石处理掉，就需要借助输尿管软镜。
所以软镜的处理范围远远大于硬镜，常规可以先尝试硬镜处理结石，如果效果不佳或者结石取不到再使用软镜处理。这二者都是使用钬激光碎石，最关键的是输尿管软镜的费用更高。
