囊肿性痤疮可以自愈，但自愈时间较为漫长，如青少年阶段出现的囊肿性痤疮，到中年阶段会逐渐消退，但消退以后并不是毫无痕迹，往往会遗留色素沉着、痘坑或瘢痕，表现为面部出现凹坑或肥厚性的瘢痕增生。因此出现囊肿性痤疮，应积极治疗，避免出现后期自愈以后更加棘手的瘢痕问题。囊肿性痤疮，在临床上属于中重度痤疮类型，常见治疗方法有以下几种：

1、局部注射药物：如果囊肿数目较少，可以局部注射药物，通常选择注射糖皮质激素，如复方倍他米松，让囊肿逐渐吸收。

2、口服药物：如果囊肿的数目比较多，可以选择口服药物治疗，如异维A酸软胶囊，异维A酸软胶囊，可以可逆性地控制皮脂腺分泌皮脂，抑制毛囊口过度角化，让囊肿结节逐渐吸收，预防或缓解痤疮后的瘢痕。它可以作用于痤疮发生的各个环节，尤其是囊肿结节性的痤疮；

3、物理治疗：选用一些物理治疗，如红蓝光、光动力，特别是光动力治疗，适合囊肿结节性痤疮，通过局部涂抹光敏剂以后照光，可以杀灭痤疮丙酸杆菌，同时让囊肿结节最大程度地恢复，减少痤疮后的瘢痕形成。